De behandeling van een prothese-infectie verschilt per patiënt. Dit hangt af van:
- het soort infectie (acuut of chronisch)
 - de bacterie (of schimmel) die de infectie veroorzaakt en welk antibioticum helpt
 - de conditie van bot, spieren en huid rond de prothese
 - de algehele gezondheid van de patiënt en medicijngebruik